MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia glumae BGR1 plasmid bglu_4p

Total Repeats: 2414

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012725	CCA	2	6	152	157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	238028978
2	NC_012725	GGA	2	6	261	266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	238028978
3	NC_012725	GCA	2	6	280	285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238028978
4	NC_012725	TCA	3	9	353	361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238028978
5	NC_012725	CGG	2	6	386	391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238028978
6	NC_012725	CTC	2	6	406	411	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	238028978
7	NC_012725	G	6	6	448	453	0 %	0 %	100 %	0 %	238028978
8	NC_012725	ACG	2	6	509	514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238028978
9	NC_012725	CCG	2	6	554	559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238028978
10	NC_012725	AGCTG	2	10	648	657	20 %	20 %	40 %	20 %	238028978
11	NC_012725	TGC	2	6	671	676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238028978
12	NC_012725	GAA	2	6	720	725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238028978
13	NC_012725	GAA	2	6	761	766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238028979
14	NC_012725	CGAT	2	8	830	837	25 %	25 %	25 %	25 %	238028979
15	NC_012725	CTG	2	6	876	881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238028979
16	NC_012725	AGC	2	6	886	891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238028979
17	NC_012725	GGT	2	6	915	920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	238028979
18	NC_012725	GGGAA	2	10	949	958	40 %	0 %	60 %	0 %	238028979
19	NC_012725	ACG	2	6	972	977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238028979
20	NC_012725	CGA	2	6	998	1003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238028979
21	NC_012725	ACG	3	9	1030	1038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238028979
22	NC_012725	CG	3	6	1053	1058	0 %	0 %	50 %	50 %	238028979
23	NC_012725	TGC	2	6	1084	1089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238028979
24	NC_012725	GAA	2	6	1121	1126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238028979
25	NC_012725	AGCG	2	8	1156	1163	25 %	0 %	50 %	25 %	238028979
26	NC_012725	CGAT	2	8	1219	1226	25 %	25 %	25 %	25 %	238028979
27	NC_012725	GGC	2	6	1231	1236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238028979
28	NC_012725	TGG	2	6	1351	1356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	238028979
29	NC_012725	CAA	2	6	1376	1381	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	238028979
30	NC_012725	CT	3	6	1474	1479	0 %	50 %	0 %	50 %	238028979
31	NC_012725	TCA	2	6	1531	1536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238028979
32	NC_012725	ACGGC	2	10	1611	1620	20 %	0 %	40 %	40 %	238028979
33	NC_012725	GCTG	2	8	1748	1755	0 %	25 %	50 %	25 %	238028979
34	NC_012725	CCGA	2	8	2999	3006	25 %	0 %	25 %	50 %	238028980
35	NC_012725	GAA	2	6	3027	3032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238028980
36	NC_012725	ATC	2	6	3177	3182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238028980
37	NC_012725	CTA	2	6	3191	3196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238028980
38	NC_012725	ACCA	2	8	3210	3217	50 %	0 %	0 %	50 %	238028980
39	NC_012725	GCT	2	6	3257	3262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238028980
40	NC_012725	GAT	2	6	3404	3409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238028980
41	NC_012725	GTT	2	6	3416	3421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	238028980
42	NC_012725	G	7	7	3450	3456	0 %	0 %	100 %	0 %	238028980
43	NC_012725	TGG	2	6	3516	3521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	238028980
44	NC_012725	CAGG	2	8	3540	3547	25 %	0 %	50 %	25 %	238028980
45	NC_012725	TTC	2	6	3582	3587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238028980
46	NC_012725	GC	3	6	3623	3628	0 %	0 %	50 %	50 %	238028980
47	NC_012725	CGAT	2	8	3658	3665	25 %	25 %	25 %	25 %	238028980
48	NC_012725	CTG	2	6	3671	3676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238028980
49	NC_012725	CGA	2	6	3709	3714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238028980
50	NC_012725	TCGGG	2	10	3745	3754	0 %	20 %	60 %	20 %	238028980
51	NC_012725	ACG	2	6	4054	4059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238028981
52	NC_012725	CGGT	2	8	4087	4094	0 %	25 %	50 %	25 %	238028981
53	NC_012725	C	6	6	4117	4122	0 %	0 %	0 %	100 %	238028981
54	NC_012725	GC	3	6	4155	4160	0 %	0 %	50 %	50 %	238028981
55	NC_012725	GCA	2	6	4195	4200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238028981
56	NC_012725	GCA	2	6	4321	4326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238028981
57	NC_012725	GCC	2	6	4369	4374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238028981
58	NC_012725	CCAC	2	8	4423	4430	25 %	0 %	0 %	75 %	238028981
59	NC_012725	TGA	2	6	4996	5001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238028982
60	NC_012725	GC	3	6	5106	5111	0 %	0 %	50 %	50 %	238028982
61	NC_012725	CA	3	6	5144	5149	50 %	0 %	0 %	50 %	238028982
62	NC_012725	CCGG	2	8	5193	5200	0 %	0 %	50 %	50 %	238028982
63	NC_012725	GCA	2	6	5216	5221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238028982
64	NC_012725	GCG	2	6	5225	5230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238028982
65	NC_012725	CAG	2	6	5291	5296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238028982
66	NC_012725	TTG	2	6	5331	5336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	238028982
67	NC_012725	GAG	2	6	5507	5512	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	238028982
68	NC_012725	TGA	2	6	5518	5523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238028982
69	NC_012725	CA	3	6	5550	5555	50 %	0 %	0 %	50 %	238028982
70	NC_012725	GCC	2	6	5658	5663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238028982
71	NC_012725	CAGCA	2	10	5696	5705	40 %	0 %	20 %	40 %	238028982
72	NC_012725	GCG	2	6	5706	5711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238028982
73	NC_012725	GC	4	8	5780	5787	0 %	0 %	50 %	50 %	238028982
74	NC_012725	GCA	2	6	5885	5890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238028982
75	NC_012725	A	6	6	5890	5895	100 %	0 %	0 %	0 %	238028982
76	NC_012725	GA	3	6	6731	6736	50 %	0 %	50 %	0 %	238028983
77	NC_012725	GCTG	2	8	6737	6744	0 %	25 %	50 %	25 %	238028983
78	NC_012725	CG	3	6	6745	6750	0 %	0 %	50 %	50 %	238028983
79	NC_012725	TTTC	2	8	6788	6795	0 %	75 %	0 %	25 %	238028983
80	NC_012725	ATC	2	6	6811	6816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238028983
81	NC_012725	CG	3	6	6819	6824	0 %	0 %	50 %	50 %	238028983
82	NC_012725	CGGCG	2	10	6833	6842	0 %	0 %	60 %	40 %	238028983
83	NC_012725	CCG	2	6	6850	6855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238028983
84	NC_012725	TCG	2	6	6859	6864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238028983
85	NC_012725	CG	3	6	6863	6868	0 %	0 %	50 %	50 %	238028983
86	NC_012725	GCT	2	6	6908	6913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238028983
87	NC_012725	AGC	2	6	6916	6921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238028983
88	NC_012725	CGG	2	6	6932	6937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238028983
89	NC_012725	GCG	2	6	6967	6972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238028983
90	NC_012725	GC	4	8	6998	7005	0 %	0 %	50 %	50 %	238028983
91	NC_012725	TCG	2	6	7105	7110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238028983
92	NC_012725	CGGC	2	8	7128	7135	0 %	0 %	50 %	50 %	238028983
93	NC_012725	GC	3	6	7146	7151	0 %	0 %	50 %	50 %	238028983
94	NC_012725	CG	3	6	7170	7175	0 %	0 %	50 %	50 %	238028983
95	NC_012725	GC	3	6	7180	7185	0 %	0 %	50 %	50 %	238028983
96	NC_012725	GGCC	2	8	7196	7203	0 %	0 %	50 %	50 %	238028983
97	NC_012725	GCAC	2	8	7297	7304	25 %	0 %	25 %	50 %	238028983
98	NC_012725	GCT	2	6	7337	7342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238028983
99	NC_012725	GCC	2	6	7343	7348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238028983
100	NC_012725	CGC	2	6	7359	7364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238028983
101	NC_012725	GCA	2	6	7430	7435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238028983
102	NC_012725	CGCCGG	2	12	7449	7460	0 %	0 %	50 %	50 %	238028983
103	NC_012725	CCG	2	6	7472	7477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238028983
104	NC_012725	CG	3	6	7513	7518	0 %	0 %	50 %	50 %	238028983
105	NC_012725	CGC	2	6	7527	7532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238028983
106	NC_012725	CGG	2	6	7533	7538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238028983
107	NC_012725	CGT	2	6	7550	7555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238028983
108	NC_012725	GGC	2	6	7575	7580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238028983
109	NC_012725	TCG	2	6	8066	8071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238028984
110	NC_012725	GGC	2	6	8120	8125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238028984
111	NC_012725	GCC	4	12	8159	8170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238028984
112	NC_012725	TGA	2	6	8253	8258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238028984
113	NC_012725	GGC	2	6	8268	8273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238028984
114	NC_012725	ACG	2	6	8280	8285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238028984
115	NC_012725	CGGC	2	8	8295	8302	0 %	0 %	50 %	50 %	238028984
116	NC_012725	CAG	2	6	8338	8343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238028984
117	NC_012725	GTG	2	6	8360	8365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	238028984
118	NC_012725	GCC	2	6	8366	8371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238028984
119	NC_012725	GTC	2	6	8465	8470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238028984
120	NC_012725	CAT	2	6	8473	8478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238028984
121	NC_012725	CGATCA	2	12	8529	8540	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	238028984
122	NC_012725	TGG	2	6	8607	8612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	238028984
123	NC_012725	TCG	2	6	8615	8620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238028984
124	NC_012725	GC	3	6	8671	8676	0 %	0 %	50 %	50 %	238028984
125	NC_012725	GC	3	6	8746	8751	0 %	0 %	50 %	50 %	238028984
126	NC_012725	CG	3	6	8761	8766	0 %	0 %	50 %	50 %	238028984
127	NC_012725	GCT	2	6	8769	8774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238028984
128	NC_012725	GGTC	2	8	8823	8830	0 %	25 %	50 %	25 %	238028984
129	NC_012725	CTT	2	6	8839	8844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238028984
130	NC_012725	GCCG	2	8	8854	8861	0 %	0 %	50 %	50 %	238028984
131	NC_012725	CGC	2	6	8879	8884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238028984
132	NC_012725	TGCC	2	8	8904	8911	0 %	25 %	25 %	50 %	238028984
133	NC_012725	AGGC	2	8	8933	8940	25 %	0 %	50 %	25 %	238028984
134	NC_012725	CTT	2	6	8980	8985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238028984
135	NC_012725	CGA	2	6	9102	9107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238028984
136	NC_012725	CCG	2	6	9144	9149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238028984
137	NC_012725	TGC	2	6	9185	9190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238028984
138	NC_012725	TCT	2	6	9288	9293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238028984
139	NC_012725	CGT	2	6	9294	9299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238028984
140	NC_012725	CGGC	2	8	9303	9310	0 %	0 %	50 %	50 %	238028984
141	NC_012725	GTGCG	2	10	9395	9404	0 %	20 %	60 %	20 %	238028985
142	NC_012725	CG	3	6	9419	9424	0 %	0 %	50 %	50 %	238028985
143	NC_012725	GC	3	6	9437	9442	0 %	0 %	50 %	50 %	238028985
144	NC_012725	CG	3	6	9500	9505	0 %	0 %	50 %	50 %	238028985
145	NC_012725	CGG	2	6	9529	9534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238028985
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152	NC_012725	TCG	2	6	9734	9739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238028985
153	NC_012725	CG	3	6	9738	9743	0 %	0 %	50 %	50 %	238028985
154	NC_012725	CGT	2	6	9747	9752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238028985
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156	NC_012725	AGTCCG	2	12	9809	9820	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	238028986
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159	NC_012725	CAG	2	6	9888	9893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238028986
160	NC_012725	CGG	2	6	9995	10000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238028986
161	NC_012725	CGC	2	6	10065	10070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238028986
162	NC_012725	CGC	2	6	10084	10089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238028986
163	NC_012725	CTGC	2	8	10151	10158	0 %	25 %	25 %	50 %	238028986
164	NC_012725	CGG	2	6	10160	10165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238028986
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391	NC_012725	GC	3	6	20162	20167	0 %	0 %	50 %	50 %	238028993
392	NC_012725	TGCCGG	2	12	20179	20190	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	238028993
393	NC_012725	CCG	2	6	20196	20201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238028993
394	NC_012725	CG	4	8	20210	20217	0 %	0 %	50 %	50 %	238028993
395	NC_012725	GGC	2	6	20219	20224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238028993
396	NC_012725	CG	4	8	20260	20267	0 %	0 %	50 %	50 %	238028993
397	NC_012725	GGA	2	6	20278	20283	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	238028993
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400	NC_012725	CCG	3	9	20442	20450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238028994
401	NC_012725	TGC	2	6	20474	20479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238028994
402	NC_012725	GGCA	2	8	20535	20542	25 %	0 %	50 %	25 %	238028994
403	NC_012725	ATC	2	6	20561	20566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238028994
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406	NC_012725	CGG	2	6	20831	20836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238028995
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500	NC_012725	GC	3	6	25626	25631	0 %	0 %	50 %	50 %	238028998

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